ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ГЕОГРАФИЧЕСКИХ КУЛЬТУР СОСНЫ КЕДРОВОЙ СИБИРСКОЙ (PINUS SIBIRICA DU TOUR)
Аннотация
Приведены результаты оценки генетического разнообразия географических культур сосны кедровой сибирской (Pinus sibirica Du Tour), произрастающей на территории Караульного участкового лесничества Учебно-опытного лесхоза СибГУ им. М.Ф. Решетнёва. В изученных лесных культурах сосны кедровой сибирской разного географического происхождения (Ярцевская, Лениногорская, Алтайская и Бирюсинская выборки) отмечается средний уровень генетического разнообразия. Большая часть генетической изменчивости сосредоточена в пределах выборок, в то время как межпопуляционная изменчивость составляет лишь 2,9%. Анализ генетических взаимоотношений показал, что исследуемые выборки объединяются в два кластера. Первый кластер сформирован Ярцевской и Бирюсинской выборками, второй – Алтайской и Лениногорской выборками. Полученные результаты могут быть использованы в долгосрочном мониторинге состояния генетических ресурсов сосны кедровой сибирской в Сибири.
Ключевые слова
Об авторах
Марина Александровна ШеллерРоссия
к. б. н., лаборант НЛ СДР, 7182-1518
Алексей Александрович Ибе
Россия
к. с.-х. н., научный сотрудник НЛ СДР, SPIN-код: 786626
Татьяна Валентиновна Сухих
Россия
лаборант НЛ СДР, SPIN-код: 1014589
Альбина Михайловна Пастухова
Россия
доцент кафедры селекции и озеленения, старший научный сотрудник научной лаборатории "Селекция древесных растений" ,
SPIN-код: 9510-3890
AuthorID: 163843
Юлия Евгеньевна Щерба
Россия
доцент кафедры селекции и озеленения СибГУ им. М.Ф. Решетнева, старший научный сотрудник НЛ СДР
Список литературы
1. Белоконь М.М., Политов Д.В., Мудрик Е.А., Полякова Т.А., Шатохина А.В., Белоконь Ю.С., Орешкова Н.В., Путинцева Ю.А., Шаров В.В., Кузьмин Д.А., Крутовский К.В. Разработка микросателлитных маркеров сосны кедровой сибирской (Pinus sibirica Du Tour) по результатам полногеномного de novo секвенирования // Генетика, 2016. № 12 (52). С. 1418-1427.
2. Бех И. А., Кравец С. А., Бисирова Э. М. Кедр - жемчужина Сибири: научно-популярное издание. Томск: Печатная мануфактура, 2009. 50 с.
3. Братилова Н.П., Калинин А.В., Крот Т.Л. Сравнительный анализ ростовых и адаптационных способностей кедровых сосен в условиях юга Средней Сибири // Материалы междунар. конф. «Плодоводство, семено-водство, интродукция древесных растений» (23–24 октября 2003 г.). Красноярск: СибГУ, 2003. № 6. С. 13-15.
4. Грибков А.В., Щур А.В., Кузменкин Д.В. Кедровые леса Алтая под угрозой: проблемы охраны и использования, рекомендации по устойчивому лесоуправлению. Москва: 2014. 64 с.
5. Крутовский К. В., Политов Д. В., Алтухов Ю. П. и др. Генетическая изменчивость сибирской кедровой сосны P. sibirica. Сообщение IV. Генетическое разнообразие и степень генетической дифференциации между популяциями // Генетика, 1989. Т. 25. № 11. С. 2009-2032.
6. Крылов Г.В., Таланцев Н.К., Козакова Н.Ф. Кедр. Москва: Лесная промышленность, 1983. 216 с.
7. Кузнецова Г.В. Опыт создания клоновой плантации кедровых сосен в Красноярской лесостепи // Хвойные бореальной зоны, 2007. XXIV. № 2-3. С. 217–224.
8. Матвеева Р.Н., Буторова О.Ф. Коллекция клонов, полусибов, раз-ных морфологических форм кедра сибирского на плантации СибГУ (юг Средней Сибири). Красноярск: СибГУ, 2012. 47 с.
9. Матвеева Р.Н., Милютин Л.И., Буторова О.Ф., Братилова Н.П. Отбор деревьев кедра сибирского высокой репродуктивной способности на географической лесосеменной плантации // Известия вузов. Лесной журнал. 2017. № 2. С. 9–17
10. Митрофанов С.В. Влияние способа прививки кедра сибирского на рост и приживаемость привоя // Лесное хозяйство, 2013. № 2. С. 120–122.
11. Орешкова Н.В., Белоконь М.М., Жамъянсурен С. Генетическое раз-нообразие, популяционная структура и дифференциация лиственниц си-бирской, Гмелина и Каяндера по данным SSR-маркеров // Генетика, 2013. Т. 49. № 2. С. 204-213.
12. Орешкова Н.В., Седельникова Т.В., Пименов А.В., Ефремов С.П. Генетическая структура и дифференциация болотных и суходольных популяций сосны кедровой сибирской (Pinus sibirica Du Tour) по ядерным микросателлитным локусам // Генетика, 2014. Т.50. № 9. С. 934-941.
13. Падутов, В.Е., Хотылева, Л.В., Баранов, О.Ю., Ивановская, С.И. Генетические эффекты трансформации лесных экосистем // Экологическая генетика, 2008. №.VI (1). C. 3-11.
14. Петрова Е.А., Белоконь Ю.С. Сравнительный анализ генетического полиморфизма в популяциях кедра сибирского (Pinus sibirica Du Tour) из Уральской и Алтае-Саянской горных областей // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2020. Т. 19, № 2. С. 81-86.
15. Приказ министерства лесного хозяйства Красноярского края от 26.09.2018 №1432-од «Об утверждении лесохозяйственного регламента Мининского лесничества».
16. Путенихина К.В. Изменчивость генеративных органов кедра сибир-ского при интродукции в Башкирском Предуралье: селекционные возможности // Материалы 4-го Междунар. совещ. по сохранению лесных генетических ресурсов ибири, Барнаул, Россия, 24–29 августа 2015 г. Красноярск: ИЛ СО РАН, 2015. С. 146-148.
17. Семечкин И.В., Поликарпов Н.П., Ирошников А.И. Кедровые леса Сибири. Новосибирск: Наука. 1985. 257 с.
18. Титов Е.В. Плантационное выращивание кедровых сосен. Воронеж: ВГЛТА, 2004. 165 с.
19. Титов Е.В. Кедр сибирский - царь сибирской тайги. Москва: Колос. 2007. 152 с.
20. Шилкина Е.А., Ибе А.А., Шеллер М.А., Сухих Т.В. Генетическая дифференциация популяций Picea оbovata L. В регионах Сибири // Хвойные бореальной зоны, 2019. Т. XXXVII. № 1. С. 68-73.
21. Blanc-Jolivet C., Yanbaev Yu., Kersten B., Degen B.A. Set of SNP markers for timber tracking of Larix spp. in Europe and Russia // Forestry, 2018. v.91. pp. 614–628.
22. Doyle J.J., Doyle J.L. Isolation of plant DNA from fresh tissue // Focus, 1990. v.12. pp. 13-15.
23. FAO. The state of the world’s forest genetic resources. Commission on genetic resources for food and agriculture, Rome, Italy, 2014. p. 277.
24. Goudet J. Hierfstat, a package for R to compute and test hierarchical F-statistics // Molecular Ecology Notes, 2005. 5. pp.184-186.
25. Graudal L., Loo J, Fady B., Vendramin G., Aravanopoulos F.A., Bald-inelli G., Bennadji Z., Ramamonjisoa L., Changtragoon S., Kjær E.D. Indicators of the genetic diversity of trees - State, Pressure, Benefit and Response. State of the World’s Forest Genetic Resources. Rome.: FAO, 2020. p. 78.
26. Jombart T., Devillard S., Dufour A.B., Pontier D. Revealing cryptic spa-tial patterns in genetic variability by a new multivariate method // Heredity, 2008. v.101. pp.92-103.
27. Hamrick J.L., Godt M.J., Sherman-Broyles S.L Factors influencing levels of genetic diversity in woody plant species // New Forests, 1992. v.6. pp. 95-124.
28. Hoban S., Bruford M., D’Urban J.J., Lopes-Fernandes M., Heuertz M., Hohenlohe P.A., Paz-Vinas I., Sjögren-Gulve P., Segelbacher G., Vernesi C., et al. Genetic diversity targets and indicators in the CBD post-2020 Global Biodiversity Framework must be improved // Biological Conservation, 2020. no.248, pp. 1-12.
29. Naoko T., Nei M., Tamura K. POPTREE2: Software for constructing population trees from allele frequency data and computing other population statistics with Windows interface // Molecular biology and evolution, 2010. v.27. no.4. pp.747-52.
30. Nei M. Genetic distance between populations // American Naturalist, 1972. v. 106. pp. 283-291.
31. Oreshkova N.V., Sedel’nikova T.S., Efremov S.P., Pimenov A.V. Genetic polymorphism of Siberian Stone Pine (Pinus sibirica Du) in Kuznetsk Alatau // Contemporary Problems of Ecology, 2020. v.13. no.6. pp. 569-576.
32. Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx V6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Molecular Ecology Notes, 2006. v.6. no.1. pp. 288-295.
33. Rai K.C., Ginwal H.S. Microsatellite analysis to study genetic diversity in Khasi Pine (Pinus Kesiya Royle Ex. Gordon) using chloroplast SSR markers // Silvae Genetica, 2018. v.67, pp. 99-105.
34. R Core Team. R: A Language and Environment for Statistical Computing; R Foundation for Statistical Computing: Vienna, Austria, 2013.
35. Semerikov V., Semerikova S., Putintseva J., Tarakanov V., Tikhonova I., Vidyakin A., Oreshkova N., Krutovsky K. Colonization history of Scots pine in Eastern Europe and North Asia based on mitochondrial DNA variation // Tree Genetics & Genomes, 2018. v.14. pp. 1-7.
36. Shah S., Qijing L., Jian Y., Shengwang M., Guang Z., Yuanyuan L., Khan D., Ahmad A., Saeed S., Mannan A. Potential geo-distribution of Pinus sibirica demonstrated by climatic similarity between Western Siberia and Northeast China // Journal of Animal and Plant Sciences, 2019. v. 29. no.4. pp. 1-8.
37. Sheller M., Tóth E.G., Ciocîrlan E., Mikhaylov P., Kulakov S., Kulakova N., Melnichenko N., Ibe A., Sukhikh T., Curtu A.L. Genetic Diversity and Population Structure of Scots Pine (Pinus sylvestris L.) in Middle Siberia // Forests, 2023. v.14. pp.1-13.
38. Sheller M., Tóth E.G., Mikhaylov P., Kulakov S., Kulakova N., Shilkina E. A., Ibe A., Sukhikh T., Blanc-Jolivet C. Genetic diversity and structure of Siberian Stone Pine (Pinus sibirica Du Tour) populations // Silvae Genetica, 2023. v.72, pp. 25-33.
39. Șofletea N., Mihai G., Ciocîrlan E., Curtu A.L. Genetic Diversity and Spatial Genetic Structure in Isolated Scots Pine (Pinus sylvestris L.) Populations Native to Eastern and Southern Carpathians // Forests, 2020, v.11. 1047 p.
40. Spielman D., Brook B.W., Frankham R. Most species are not driven to extinction before genetic factors impact them // Proceedings of the National Academy of Sciences, 2004. no.101, 15261-15264 pp.
41. Shuvaev D.N., Ibe A.A. Genetic structure and postglacial recolonization of Pinus sibirica Du Tour in the West Siberian Plain, inferred from nuclear mi-crosatellite markers // Silvae Genetica, 2021. v.70. pp. 99-107.
Рецензия
Для цитирования:
Шеллер М.А., Ибе А.А., Сухих Т.В., Пастухова А.М., Щерба Ю.Е. ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ГЕОГРАФИЧЕСКИХ КУЛЬТУР СОСНЫ КЕДРОВОЙ СИБИРСКОЙ (PINUS SIBIRICA DU TOUR). Известия Санкт-Петербургской лесотехнической академии. 2026;(258).
JATS XML





